山本五十六还将俯冲轰炸机、水平轰炸机、鱼雷轰炸机和战斗机等不同种类战机组成一支支的空中攻击部队。
他选中以南九州鹿儿岛湾练习低空投放鱼雷和炸弹，要求鱼雷机训练投弹高度为从没做过的1500尺，并严格训练命中率较低的水平轰炸机。而青森县三泽飞行场旁的小川原湖，亦因条件类似珍珠港而成为练习地点。
山本将整只舰队交由南云忠一中将指挥，并另外派遣6艘袖珍潜艇，作为空袭失败后对美国舰队突击的功用。并且按原定计划，若在航母舰队移动时就被美军发现，便随即取消作战行动。
日本人在进攻之前，已经收到了潜伏于珍珠港日本间谍的资讯，得知那时珍珠港内共停泊着美军9艘战列舰、4艘巡洋舰、驱逐舰19艘，船坞内则有巡洋舰5艘、驱逐舰3艘。
更重要的是还有两艘美军的航空母舰也停泊在港内，一艘是美国的突击级航母“游骑兵号”，另外一艘则是今年年初刚刚服役美国海军的约克级航母的第二艘“企业号”。
企业号作为刚刚服役的航母，美军正在对它做试航，就从美国本土一路行驶到了太平洋，暂时在珍珠港内补充补给。
当山本五十六得到这个情报的时候，山本五十六马上意识到这是重创美国海军的大好机会，如果此时干掉美国的这两艘航母，再加上这几十艘战舰，那么美国在太平洋的海军差不多就全灭了，到时候至少美国一年之内顾不到日本。
所以山本五十六将这次偷袭美军珍珠港的重点打击目标选中为美军航母，他要求舰队指挥官南云忠一务必要将美军的这两艘航母彻底击沉。
可是山本五十六不知道的是，美国人还是比较幸运的，因为美国在日本展开进攻之前，“企业号”航母就出港进入东太平洋进行海上训练了，所以侥幸躲过一劫。
1939年7月12日点上午9点30分，东京帝国紧急召开国会在一阵的喧闹之后做出了一个决定，随后太平洋上的南云忠一于在次日凌晨5点30分收到了计划继续的命令。
因为那时候的日本已经收到了在美国的谈判代表团发回的情报，得知美国拒绝了他们的要求，不会放弃对日本的禁运以及冻结资产的决议，所以日本人决定继续执行他们的偷袭计划。
此时的南云忠一已经率领日本的航母舰队靠近了美军的珍珠港，不过依然还有很长的距离，所以美军并没有发现他们。
“诸君！帝国兴废，系于此战，各官兵必要尽其职，鞠躬尽瘁！”南云忠一对着航母甲板上，那些已经穿戴好了的日军飞行员们深深的一个鞠躬：“拜托！”
“哈伊！”众多日军飞行员答道。
随后，却见那些原本平静的日军航母上一架架的战机发出了震天的轰鸣声，从航母上冲天而起，向着远处美军的珍珠港飞去。
而当日本展开进攻时，夏威夷此时还正处于星期天太阳未升起的早晨，岛上只有少数人起来，大部分士兵都还处于休息状态。
在奥帕纳雷达站中的两位美军二等兵，在于6点45分在雷达屏幕上发现有不明物体靠近瓦胡岛（这实际上就是南云派出的日军侦察机），却这两名美军士兵却没有上报，没有他们根本就没有想到这会是敌人的飞机。
并且昨晚珍珠港内的美军们还举行酒会来庆祝美国“企业号”的到来，但是由于按计划第二天“企业号”就要出海训练，所以所有“企业号”的美军士兵都没有喝酒，他们在凌晨6点的时候就起航离港了。
不过珍珠港内驻守的美军官兵可就没有这个限制了，他们整整狂欢了一夜大家，不少士兵都喝醉了，都很疲惫，就连第二天需要执勤的美军士兵，即便是没有喝醉，也喝了不少。
这使得此时大部分美军军官和士兵们都在酣睡中，除去少数执勤人员在迷迷糊糊的执勤之外，整个瓦胡岛是那样的平静。
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